Depuis 1994, des relevés de pêche sentinelle ont été effectués dans le sud du Golfe du Saint Laurent (Zone 4T de l’OPANO). Des navires commerciaux suivent un protocole scientifique prédéterminé pour recueillir de l’information sur l’état des stocks de morue franche dans le sud du golfe du Saint-Laurent. Entre 1994 et 1995 ces relevés étaient financés principalement par le Ministère du Développement des Ressources Humaines (DRHC), et le MPO fournissait de l’expertise scientifique pour assister à leur réalisation ainsi que des fonds pour couvrir le déploiement des observateurs et l’achat de matériel scientifique nécessaire à l’échantillonnage. Depuis 1996, les relevés de pêche sentinelle sont financés entièrement par le MPO.
Suite à une revue des relevés de pêche sentinelle dans l’Atlantique en décembre 2002, la décision a été prise de diminuer la portée des relevés fixes dans le sud du Golfe du Saint-Laurent pour n'inclure que les relevés à la palangre. À la fin de 2020, le secteur des sciences du MPO ont engagé des partenaires de l'industrie de la pêche qui avaient déjà participé aux relevés de pêche sentinelle. L’objectif était de discuter des possibilités de réaligner le programme afin d’assurer la participation de l’industrie et de lui permettre de fournir des informations scientifiques précieuses. Suite à ces discussions et jusqu'à ce qu'une révision permanente de ce programme soit achevée, pour 2021, un projet temporaire sera mené pour mieux comprendre les conditions biologiques de la morue tout au long de la saison. Tous les travaux seront effectués sous contrat avec des organisations de pêcheurs.
