Entente sur le commerce : ALÉNA/ACI/et les ALE entre Canada et Pérou/Colombie/Panama
Processus de demande des soumissions : Habituellement, une seule entreprise est invitée à soumissionner
Stratégie d'approvisionnement non concurrentielle : Droits exclusifs
Entente sur les revendications territoriales globales : Non
Nom et adresse du fournisseur :
Bio-Rad Laboratories (Canada) Ltd.
1329 Meyerside Drive
Mississauga Ontario
Canada
L5T1C9
Nature des besoins :
01633-170824/A
Omerzo, Zeljka
N° de téléphone - (204) 510-2597
Nº fax - (204) 983-7796
Article 1, système de RCP numérique à gouttelettes
1. Préavis d'adjudication de contrat
Un PAC est un avis public informant la collectivité des fournisseurs qu'un ministère ou organisme a l'intention d'attribuer un contrat pour des biens, des services ou des travaux de construction à un fournisseur sélectionné à l'avance, ce qui permet aux autres fournisseurs de signaler leur intérêt à soumissionneren présentant un énoncé des capacités. Si aucun fournisseur ne présente un énoncé des capacités qui satisfait aux exigences établies dans le PAC, au plus tard à la date de clôture indiquée dans le PAC, l'agent de négociation des contrats peut procéder àl'attribution du contrat au fournisseur sélectionné à l'avance.
2. Définition des besoins
Molecular genetics and genomics research at Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC) - Brandon involves a broad suite of activities. Researchers apply genetic approaches using molecular tools, conduct transgenic studies, investigate plant development and physiology and characterize plant pathogens. A common essential need in these research projects is to quantify nucleic acids with high precision, sensitivity, and specificity at a high throughput level. These investigations often involve very limited amounts of nucleic acid samples, as from micro-dissected tissues. The new emerging Droplet Digital PCR (ddPCR) technology offers a very robust system for absolute quantification of nucleic acids and is required to meet the research needs at AAFC-Brandon.
3. Critères d'évaluation de l'énoncé des capacités (Exigences essentielles minimales)
Tout fournisseur intéressé doit démontrer au moyen d'un énoncé des capacités que son matériel satisfait aux exigences suivantes :
1. Les échantillons ddRCP sont amplifiés dans un plateau standard à 96 cuvettes sur un cycleur thermique avec gradient pour permettre un débit d'échantillonnage élevé et l’optimisationdu gradient pour de nouveaux échantillons.
2. Le lecteur ddRCP analyse 32 échantillons/heure sans surveillance et sans intervention manuelle.
3. Le système RCPH est d'une ampleur "paillasse" doit lire des échantillons dans des plaques de format standard à 96 puits pour permettre l'incorporation dans nos workflows existants et utiliser thermocyclers standards déjà présents à l'ITI-Saskatoon. Workflows existants utilisent une étape de PCR à gradient de température pour optimiser les conditions d'essai et le nouveau système de RCPH demandée doit être en mesure d'intégrer une étape PCR à gradient de température. La capacité de gradient de température ne doit exiger aucun pipetage ou étape de manipulation de liquide additionnels car ces manipulations introduiraient des erreurs supplémentaires dans l'expérience.
4. Le système DPCR doit analyser 96 échantillons uniques à moins de 5 heures, y compris les étapes consistant à 1) de cloisonnement des dosages d'échantillons dans 12 000 à 20 000 cloisons de laréaction, 2) amplification par PCR et 3) de lecture et marquer les partitions de la réaction. Nota : Cette exigence est nécessaire afin d'analyser plusieurs échantillons simultanément sans introduire de source potentielle d'erreur comme pourles analysespar tube simple. En outre, ces caractéristiques sont nécessaires pour répondre aux exigences de rapidité de traitement des échantillons des multiples utilisateurs de plusieurs programmes de recherche d'AAC ainsi que des partenaires industriels potentiels à Brandon.
5. Ce système ddRCP devrait inclure le générateur de gouttelettes et le lecteur de gouttelettes. Le lecteur de gouttelettes DOIT comporter un échantillonneur automatique à 96 cuvettes de sorte que le fonctionnement sans surveillance soit possible afin de maximiser le débit d'échantillons, et afin qu'il puisse servir à plusieurs utilisateurs et/ou traiter plusieurs plateaux par jour.
6. Le système RCPH doit produire 12.000 à 20.000 partitions de réaction par échantillon pour 96 échantillons uniques dans 30 minutes ou moins.
7. Le système de RCPH qui est compatible avec chimies liaison à l'ADN (par exemple EvaGreen) ainsi que la chimie de la sonde hydrolosis utilisant FAM et / ou des colorants HEX et doit détecter les signaux de fluorescence correspondant à celles dérivées de VIC-HEX-, EvaGreen-ou FAM marqué sondes PCR.
8. Le système DPCR doit distinguer les gènes copie variantes de nombre de 11 par rapport à 10 et inférieure à l'aide de deux ou moins de réactions de dosage de l'échantillon d'un puits de réaction chacune (ce qui équivaut à une chambre ou d'un panneau d'une puce de réaction) à une entrée de matrice d'acide nucléique équivalent à 100 ng d'ADN génomique végétal ou microbse 'ou moins de façon à minimiser quantité de taille de l'échantillon d'acide nucléique requise par dosage et le coût de consommables. Cette capacité doit être atteint sans la nécessité d'une étape de pré-amplification qui peut entraîner un biais de mesure importante en déformant l'abondanceet la présence relative des acides nucléiques cibles.
9. Le système RCPH doit permettre l'analyse de l'expression génique et la quantification des copies d'ADN avec + / - 10% de précision pour répondre aux exigences des utilisateurs multiples à partir de plusieurs programmes de recherche. Le système comprend des modules de l'expression génique qui permet d'analyser et de produire des niveaux d'expression des gènes précis dans l'échantillon.
10. Le système DPCR doit détecter un variant génétique spécifique à un niveau aussi faible que 0,001% abondance dans un mélange échantillon qui comprend d'autres variantes génétiques, et à permettre une quantification linéaire de cette variante plus de quatre ordres de grandeur de l'abondance de cette variante dans un mélange complexe des acides nucléiques.
11. Le système RCPH ne doit pas nécessiter le développement de courbes standard ou besoin d'un calibrateur externe pour estimer l'abondance relative des acides nucléiques cibles, réduisant ainsi le nombre d'échantillons doivent être préparés et analysés. Au contraire, l'appareil doit produire des données numériques reflétant quantification absolue de l'abondance de l'acide nucléique cible.
12. Le système PCR numérique doit avoir un volume de séparation de réaction de 1 nL ou moins.
13. L'incertitude relative élargie du système de RCPH à partir des données de 20.000 partitions de réaction est nécessaire pour être 5% ou moins pour obtenir la précision des données requises par les programmes de recherche.
14. Le systèmedoit générer DPCR 12000 à 20000 cloisons de réaction à partir d'un volume de réaction de l'échantillon de 20 microlitres.
15. Le système RCPH ne doit pas nécessiter l'utilisation d'équipements de traitement des liquides spécialisés ou manipulateurs de liquide robotiques qui nécessitent généralement une formation spécialisée et d'un technicien dédié à fonctionner car le système sera utilisé par de nombreux chercheurs provenant de plusieurs programmes.
16. Le système doit générer et DPCR partition de réaction de dosage de manière à minimiser le volume mort du titulaire de la cloison et le lecteur à
