Entente sur le commerce : ALÉNA/ACI/et les ALE entre Canada et
Pérou/Colombie/Panama
Processus de demande des soumissions : Habituellement, une seule
entreprise est invitée à soumissionner
Pièce jointe : Aucune
Stratégie d'approvisionnement non concurrentielle : Objectifs
gouvern. représentant les meilleurs intérets/valeur pour l'État
Entente sur les revendications territoriales globales : Non
Nom et adresse du fournisseur :
Bio-Rad Laboratories (Canada) Ltd.
1329 Meyerside Drive
Mississauga Ontario
Canada
L5T1C9
Nature des besoins :
système de RCP numérique à gouttelettes
31029-133315/A
Allard, Ken
Telephone No. - (204) 983-4920
Fax No. - (204) 983-7796
Un PAC est un avis public informant la collectivité des
fournisseurs qu'un ministère ou organisme a l'intention
d'attribuer un contrat pour des biens, des services ou des
travaux de construction à un fournisseur sélectionné à l'avance,
ce qui permet aux autres fournisseurs de signaler leur intérêt à
soumissionner en présentant un énoncé des capacités. Si aucun
fournisseur ne présente un énoncé des capacités qui satisfait
aux exigences établies dans le PAC, au plus tard à la date de
clôture indiquée dans le PAC, l'agent de négociation des
contrats peut procéder à l'attribution du contrat au fournisseur
sélectionné à l'avance.
Contexte:
Génétique moléculaire et de recherche en génomique au Conseil
national de recherches du Canada (CNRC) - Saskatoon implique une
vaste gamme d'activités. Les chercheurs appliquent des approches
génétiques utilisant des outils moléculaires, mener des études
transgéniques, d'enquêter sur le développement et physiologie
des plantes, plante caractérisent métagénomique et mener des
études de populations microbiennes. Un besoin essentiel commun à
ces projets de recherche est de quantifier les acides nucléiques
avec une grande précision, la sensibilité et la spécificité d'un
niveau à haut débit, comme liées à la détermination du nombre de
copies native et trans-gènes, de détection et de quantification
des variants génétiques et des acides nucléiques cibles dans
mélanges complexes, et la détermination des niveaux d'expression
des gènes. Ces enquêtes impliquent souvent des quantités très
limitées d'échantillons d'acides nucléiques, à partir de
microdissection des tissus. La nouvelle technologie émergente
numérique PCR (RCPH) offre système très robuste pour la
quantification absolue des acides nucléiques et est nécessaire
pour répondre aux besoins de la recherche à l'IBP-Saskatoon.
Tout fournisseur intéressé doit démontrer au moyen d'un énoncé
des capacités que son produit/matériel/système (selon le cas)
satisfait aux exigences suivantes:
Critères d'évaluation de l'énoncé de capacités - Spécifications
de performances minimales essentielles:
1. Le système RCPH est d'une ampleur "paillasse" doit lire des
échantillons dans des plaques de format standard à 96 puits pour
permettre l'incorporation dans nos workflows existants et
utiliser thermocyclers standards déjà présents à
l'ITI-Saskatoon. Workflows existants utilisent une étape de PCR
à gradient de température pour optimiser les conditions d'essai
et le nouveau système de RCPH demandée doit être en mesure
d'intégrer une étape PCR à gradient de température. La capacité
de gradient de température doit NOTrequire quelconque pipetage
supplémentaire ou des étapes de manipulation de liquides car
ceux-ci d'introduire des erreurs supplémentaires dans
l'expérience.
2. Le système DPCR doit analyser 96 échantillons uniques à moins
de 5 heures, y compris les étapes consistant à 1) de
cloisonnement des dosages d'échantillons dans 12 000 à 20 000
cloisons de la réaction, 2) amplification par PCR et 3) de
lecture et marquer les partitions de la réaction.
3. Ce système devrait inclure RCPH générateur de gouttelettes et
lecteur de gouttelettes. Le lecteur gouttelettes doit intégrer
un auto-échantillonneur 96 puits de sorte que le fonctionnement
sans surveillance est possible d'optimiser le débit de
l'échantillon.
4. Le système RCPH doit produire 12.000 à 20.000 partitions de
réaction par échantillon pour 96 échantillons uniques dans 30
minutes ou moins.
5. Le système de RCPH qui est compatible avec chimies liaison à
l'ADN (par exemple EvaGreen) ainsi que la chimie de la sonde
hydrolosis utilisant FAM et / ou des colorants HEX et doit
détecter les signaux de fluorescence correspondant à celles
dérivées de VIC-HEX-, EvaGreen-ou FAM marqué sondes PCR.
6. Le système DPCR doit distinguer les gènes copie variantes de
nombre de 11 par rapport à 10 et inférieure à l'aide de deux ou
moins de réactions de dosage de l'échantillon d'un puits de
réaction chacune (ce qui équivaut à une chambre ou d'un panneau
d'une puce de réaction) à une entrée de matrice d'acide
nucléique équivalent à 100 ng d'ADN génomique végétal ou
microbse 'ou moins de façon à minimiser quantité de taille de
l'échantillon d'acide nucléique requise par dosage et le coût de
consommables. Cette capacité doit être atteint sans la nécessité
d'une étape de pré-amplification qui peut entraîner un biais de
mesure importante en déformant l'abondance et la présence
relative des acides nucléiques cibles.
7. Le système RCPH doit permettre l'analyse de l'expression
génique et la quantification des copies d'ADN avec + / - 10% de
précision pour répondre aux exigences des utilisateurs multiples
à partir de plusieurs programmes de recherche. Le système
comprend des modules de l'expression génique qui permet
d'analyser et de produire des niveaux d'expression des gènes
précis dans l'échantillon.
8. Le système DPCR doit détecter un variant génétique spécifique
à un niveau aussi faible que 0,001% abondance dans un mélange
échantillon qui comprend d'autres variantes génétiques, et à
permettre une quantification linéaire de cette variante plus de
quatre ordres de grandeur de l'abondance de cette variante dans
un mélange complexe des acides nucléiques.
9. Le système RCPH ne doit pas nécessiter le développement de
courbes standard ou besoin d'un calibrateur externe pour estimer
l'abondance relative des acides nucléiques cibles, réduisant
ainsi le nombre d'échantillons doivent être préparés et
analysés. Au contraire, l'appareil doit produire des données
numériques reflétant quantification absolue de l'abondance de
l'acide nucléique cible.
10. Le système PCR numérique doit avoir un volume de séparation
de réaction de 1 nL ou moins.
11. L'incertitude relative élargie du système de RCPH à partir
des données de 20.000 partitions de réaction est nécessaire pour
être 5% ou moins pour obtenir la précision des données requises
par les programmes de recherche.
12. Le système doit générer DPCR 12000 à 20000 cloisons de
réaction à partir d'un volume de réaction de l'échantillon de 20
microlitres.
13. Le système RCPH ne doit pas nécessiter l'utilisation
d'équipements de traitement des liquides spécialisés ou
manipulateurs de liquide robotiques qui nécessitent généralement
une formation spécialisée et d'un technicien dédié à fonctionner
car le système sera utilisé par de nombreux chercheurs provenant
de plusieurs programmes.
14. Le système doit générer et DPCR partition de réaction de
dosage de manière à minimiser le volume mort du titulaire de la
cloison et le lecteur à
